Theo đó, căn cứ vào các tài liệu, chứng cứ thu thập được trong quá trình tiếp nhận tin báo, tố giác tội phạm cộng với kết quả giám định xác định, không có dấu hiệu của tội phạm nên Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh đã ra quyết định không khởi tố vụ án.
Viện KSND tỉnh Đồng Nai cũng đã có văn bản thống nhất quan điểm với cơ quan điều tra không khởi tố vụ án hình sự.
Theo quyết định của Cơ quan Cảnh sát điều tra Công an tỉnh, sau kiểm tra, xác minh nguồn tin báo về tội phạm xác định, hành vi nhập khẩu phân bón, sang chiết, đóng chai phân bón nhập khẩu; sản xuất và buôn bán phân bón của Công ty Thuận Phong chỉ là vi phạm hành chính, không cấu thành tội buôn bán hàng cấm và tội sản xuất, buôn bán hàng giả là phân bón được quy định tại các Điều 155 và 158 Bộ luật Hình sự năm 1999.
Trước đó, tháng 4.2015, Văn phòng Ban chỉ đạo 389 quốc gia phối hợp với Cơ quan thường trực Ban chỉ đạo 389 tỉnh tiến hành kiểm tra nhà xưởng sản xuất phân bón của Công ty Thuận Phong (đóng tại P.Long Bình, TP.Biên Hòa).
Qua kiểm tra đoàn đã phát hiện tại xưởng sản xuất của này có công nhân đang sang chiết phân bón dạng nước vào chai thành phẩm có dán nhãn hiệu Vitol có nguồn gốc xuất xứ Hoa Kỳ (Made in USA) có nghi vấn sản xuất hàng giả.
Vụ việc sau đó được chuyển cho Công an tỉnh Đồng Nai thụ lý điều tra.